参合农民持证件（身份证、户口本、合疗本、参合票、转诊单） → 前往合疗科办理登记 → 相关科室住院治疗 → 出院持合疗报销材料（出院证、诊断证明、自费项目单、特检审批表、病历、患者证件前往合疗科审核、报销 → 收费处领取补偿款。
